中国人民解放军联勤保障部队第969医院以原253、291医院为基础调整组建而成。营区中以原第253医院历史最为悠久，是我党我军第一所医院，1933年始建于江西瑞金，时称中央红色医院，先后参加过长征、抗日战争、解放战争和抗美援朝战争，首任院长是中国人民解放军和新中国医疗卫生事业的奠基人、创始人之一傅连暲。先后经过次多调整整编，2018年11月组建中国人民解放军联勤保障部队第969医院。1997年被原总后勤部评定为三级甲等医院，2014年顺利通过军队“三甲”医院复审。医院先后被表彰为全国拥政爱民模范单位、全国学雷锋先进单位、全国三八红旗集体；被原总部表彰为“神舟载人航天飞行卫勤保障先进单位”、“全军为部队服务先进医院”。现有两个院区，即呼市院区（位于内蒙古自治区呼和浩特市新城区爱民街111号）和包头院区（位于包头市东河区康复路）。