常熟市妇幼保健所创建于1950年，于1982年建成妇幼保健院，后合并至市中医院，2004年，为促进全市妇幼保健事业的发展，市政府将设在常熟市妇幼保健院内的常熟市妇幼保健所单独设置，2006年12月23日，常熟市妇幼保健所迁址富阳路6号常熟市公共卫生中心内。
　　常熟市妇幼保健所是从事妇幼保健的专业机构和全市妇幼保健技术指导中心,主要对占总人口三分之二的妇女儿童提供妇幼保健系列服务。全所现有工作人员24名，卫技人员21名。内设科室有群体保健科、妇女保健科、儿童保健科、行政办公室等科室。
　　常熟市妇幼保健所坚持以保健为中心、保健与临床相结合的发展方向，以群体保健工作为基础，面向基层、预防为主，提供儿童保健，儿童营养指导，新生儿疾病筛查，婚前医学检查，青春期保健，孕产期保健，更年期保健，计划生育技术服务，产前筛查与诊断等妇幼保健服务；同时开展重大妇幼卫生项目指导，托幼机构卫生保健指导，孕产妇和婴儿死亡及出生缺陷发生情况监测，妇幼卫生信息统计上报，协助卫生行政部门制定妇幼卫生政策、技术规范和工作制度等工作。
　　常熟市妇幼保健所在上级部门的领导下，认真贯彻落实《母婴保健法》，为妇女儿童提供优质的公共卫生服务。目前，我所已多次得到苏州市卫生局妇幼保健先进奖，所档案室通过江苏省一级档案室，儿童保健科、妇女保健科获得分别获得省和苏州市“巾帼文明岗”称号。