温州市妇幼保健所是温州市卫计委直属具有公共卫生性质的公益性事业单位。单位由妇女保健科、围产儿保健科、儿童保健、儿童健康管理科和信息宣教科等核心科室组成，并设有温州市新生儿疾病筛查中心、温州市儿童听力筛查管理中心、温州市产前筛查、产前诊断管理中心、妇幼健康管理中心。目前工作内容包括协助卫生行政部门制定本辖区妇幼健康工作的相关政策、技术规范及各项规章制度；受卫生行政部门委托对本辖区各级各类医疗保健机构开展的妇幼健康服务进行检查、考核与评价；负责指导和开展本辖区的妇幼健康教育与健康促进工作；组织实施母婴保健技术培训，对基层医疗保健机构开展业务指导，并提供技术支持；负责辖区孕产妇死亡、婴儿及5岁以下儿童死亡、出生缺陷监测、重大公共卫生妇幼项目、妇幼健康服务及技术管理等信息的收集、统计、分析、质量控制和汇总上报；开展妇女保健和儿童保健服务。