高邮市中医医院是一所集中医医疗、预防、教学、科研、急救、康复为一体的国家三级乙等中医医院，系南京中医药大学、安徽中医药大学教学医院、江苏省首批中医“治未病”健康工程试点单位。医院先后被授予江苏省“价格诚信单位”、扬州市“规范收费医院、扬州市卫生系统“三好一满意”、“白求恩杯”竞赛、中医医院管理年活动先进单位、高邮市文明单位等称号。
医院拥有两个院区，建筑面积6万平方米。科室设置齐全，设有40个临床医技科室，其中，针灸推拿科为国家中医药管理局农村中医特色专科建设单位；肿瘤科为江苏省中医重点专科；儿科为江苏省中医临床特色专科建设单位、扬州市“十三五”中医药重点学科建设单位；骨伤科为扬州市中医临床重点学科建设单位；骨伤科、肾病科、儿科、肿瘤科、心病科、脑病科、脾胃病科、针灸康复科为扬州市中医临床重点专科；设有国医大师传承工作室1个、全国基层名老中医药专家传承工作室1个、省级名中医传承工作室1个、扬州市中医药名师工作室3个。
医院拥有瓦里安医用直线加速器、飞利浦64排128层CT、东软16排螺旋CT、GE1.5T磁共振、西门子双板DR、贝朗血透机、GE彩色B超、奥林巴斯电子胃肠镜、科曼腹腔镜、奥林巴斯全自动生化分析仪、罗氏化学发光仪等一大批诊疗设备、以及中医体质辨识仪、中医经络检测仪等一批中医诊疗设备。医院建有符合GMP标准的制剂室，生产13种剂型、近30种中药制剂。
医院现有职工711人，其中卫技人员591人、正高级职称25人、副髙级职称87人、硕士研究生39人。拥有江苏省“333工程”人才1人、全国中医护理骨干人才培养对象1人、江苏省优秀中青年中医临床人才1人、江苏省“卫生拔尖人才”1人、扬州市名中医5人、高邮市有突出贡献的中青年专家13人、高邮市名中医10人、高邮市“秦邮英才”培育对象1人。医院编制床位800张，17个病区和一个血液透析中心。
医院继承弘扬祖国传统医学精髓，坚持“融汇中西、强化特色、惠泽百姓”的办院方针，为建设“中医水平站在前沿，现代医学跟踪得上”的基本现代化中医医院而不懈努力。