西南医院坐落于两江环抱、山水相依的重庆市沙坪坝区高滩岩上，有着悠久的历史和光荣的传统。医院前身系国民政府中央医院，1929年建于南京，1941年迁至重庆，1950年正式命名，现为第三军医大学第一附属医院、西南临床医学院。经过80多年的建设发展，业已成为一所集医、教、研于一体的大型综合性现代化“三级甲等”医院。医院占地面积300余亩，建筑面积36万平方米，展开床位2900余张，仪器设备总值15亿元，拥有达芬奇手术机器人、PET/CT、3.0MRI、双源螺旋CT、ECT、脑磁图、大型高压氧舱群、神经导航系统等一系列高精尖诊疗设备。2016年门急诊量382万人次、收容量13.2万人次、手术量9.6万台次，医教研护工作协调发展，办院综合实力国内一流。
　　学科优势明显。拥有国家重点学科10个(烧伤科、肝胆外科、感染病科、泌尿外科、神经外科、骨科、胸心外科、整形外科、心血管内科、呼吸内科)，国家重点培育学科2个(消化内科、眼科)；国家中医药管理局重点学科1个(中西医结合科)，全军医学研究所7个(烧伤科、肝胆外科、感染病科、泌尿外科、消化内科、神经外科、病理科)，全军医学专科、专病中心7个(骨科、眼科、普通外科、检验科、妇产科、心血管内科、康复理疗科)，全军卫生信息基地1个，国家重点实验室2个，“组织工程国家地方联合工程实验室”1个。临床医学一级学科均为博士学位授权学科及重庆市重点学科。
　　人才实力雄厚。先后产生工程院院士2名，现有重庆市医口惟一的中国科学院院士1名，院士后备人选2名。有各类专业技术人员5000余人，其中高级职称455名，享受政府特殊津贴专家44名，“973”首席科学家4名，长江学者1名，国家杰出青年基金获得者4名，博士、硕士生导师209人。
　　医疗特色突出。形成了创(烧)伤、消化系疾病(肝病)、心脑血管病、感染病、泌尿系疾病、眼病、肿瘤综合诊治、康复整形等八大临床优势领域；培育了乳腺、关节、风湿病、眼底病、前列腺疾病、疼痛治疗、心理治疗、优生优育等八大临床专病特色；锻造了大器官移植(心、肝、肾、多器官联合)、全系列微创外科(各系统腹腔镜、介入、内镜、射频)、危急重症救治、组织工程修复、基因诊断治疗等五大临床核心技术。
　　科技创新活跃。先后获得国家科技进步一等奖3项、二等奖16项，军队（省部级）科技进步（医疗成果）一等奖35项、二等奖146项。承担省部级以上课题1200余项，其中“973”、“863”等国家重大、重点项目62余项，获科研经费5.8亿元。在国外SCI收录杂志发表论文900余篇，最高单篇影响因子53.3。2013年度专利数量居全国医疗机构第一位。
　　医院始终坚持姓军为兵、姓军为战的办院方向，秉承“做行业典范、建一流名院”的建院理念，按照“适度规模、内涵建设、创新发展，以质量特色取胜”的发展思路，努力建设“跻身世界一流名院方阵的研究型医院”。
　　2002年，在国内较早通过英国皇家标准协会(BSI)的IS09001质量管理体系认证；
　　2003年，建成9.7万平方米的外科大楼；
　　2006年，建成设施完备、功能齐全的临床技能模拟培训中心；
　　2007年，建成7.6万平方米、能够同时容纳一万人就诊、集现代化智能化人性化生态化于一体的新门急诊大楼，获评全国“首批数字化试点示范医院”；
　　2010年，通过国际SIDCER伦理认证；
　　2012年，获评首批研究型医院建设试点医院；
　　2014年，获评军队研究型医院建设示范单位。
　　先后获全国百姓放心百佳示范医院、全国优质服务百佳医院、全国医院文化建设先进单位、全国精神文明建设先进单位、全军先进医院、全军为部队服务先进单位、总后先进师旅团级党委、重庆市民看病首选医院等殊荣。