南京市胸科医院，又名东南大学医学院附属南京胸科医院，始建于1950年，是江苏省规模最大的胸部疾病专科医院，承担着省、市胸部疾病的医疗、教学、科研任务。
　　医院目前有开放床位500张，职工648人，其中专业技术人员576人。设有胸心外科、呼吸内科、心血管内科、麻醉科、重症医学科、放疗科、中西医结合科、急救中心、内镜中心等临床科室以及药学部、医学影像科、检验科、病理科、心导管室、气管镜室等医技科室；另有胸心外科研究室、胸部肿瘤研究室、中心实验室等。　医院技术力量雄厚，在胸部疾病的诊断、治疗等方面，具有较高的专科水平。“南京市肺灌洗中心”、南京呼吸病及影像临床医学中心设在我院，是国家卫计委“中国地/县域医院肿瘤微创技术推广项目”（简称321工程）江苏省培训基地。胸心外科、呼吸内科、心血管内科、药学部、检验科、重症医学科为南京市医学重点专科。肺癌、肺部小结节年早期诊断突破万例，目前正积极开展肺部小结节专病的系统化管理工作。开展了华东地区首例自主呼吸麻醉下单孔胸腔镜肺叶切除术、江苏省首例单孔胸腔镜气管肿瘤切除术、江苏省首例单孔胸腔镜袖状肺叶切除术、江苏省首例完全胸腔镜袖状肺叶切除术等技术。医院高度重视科研发展。近五年来，多次获得省、市科技进步奖，其中作为主要承担单位参与国家"十二五"重大传染病专项基金课题3项，中科院战略性先导科技专项1项；国家自然科学基金、省自然科学基金多项；获得实用新型专利10余项，SCI论文70余篇。
　　医院积极深入推进综合医院改革工作，发挥专科特色和技术优势，深入探索专科医院医联体建设合作的新机制新模式。目前已与浦口区中医院、雨花医院等兄弟单位建立了医联体关系，同时不断加强和天长市、和县等周边区县医院合作的紧密程度，积极为其提供技术指导和技术支持。
　　医院始终以病人为中心，以双满意文化建设为载体，实施科学管理，打造医院品牌。荣获卫生部“2012医院改革创新奖”，多次被授予省、市级“江苏省精神文明建设先进单位”、“省卫生行风先进集体”、“省院务公开民主管理先进单位”、“江苏省五四红旗团委”等荣誉。