南通市第二人民医院位于港闸区通扬河畔、中国近代工业发源地之一的唐闸，始建于1914年，前身是志明医院、南通市工人医院，现已发展为一所集医疗、保健、教学、科研、康复、预防为一体的大型市级综合性医院，为江苏省住院医师规范化培训基地，江苏省全科医生培养省级示范临床基地，南通大学教学医院，复旦大学附属中山医院医疗合作医院，中科院苏州医工所临床实验基地，南通惠民医疗定点医院。
现有职工680余人，其中高中级专业技术人员284人，博士6人，硕士研究生67人，硕士生导师2人，院校兼职教授39人，具备合理的人才梯队。有完善的科室设置，编制床位1000张。设有15个病区，25个临床专科，8个医技科室，拥有1个市级医学重点学科，4个市级临床重点专科，9个市级临床重点专科建设专科。骨科为南通市首批市级临床重点专科，康复医学科为南通市医学重点学科、临床重点专科，消化内科、检验科为市临床重点专科。神经内科、心血管内科、肾内科、神经外科、泌尿外科、肿瘤科、妇产科、儿科、药剂科为南通市临床重点建设专科。
医院医疗设备先进齐全，配有64排CT、3.0T核磁共振、DSA、康复机器人、DR、气压弹道碎石系统、骨密度测量仪、钬激光碎石机、全自动生化分析仪，各种纤维内窥镜、血透机、全能麻醉机、高压氧舱、彩色多普勒超声诊断仪、超声骨刀、C臂机等现代化诊断治疗设备。
近年来，医院不断加快提档升级步伐，与知名院校开展医教研深度合作，提升医院综合实力和服务水平。与上海复旦大学附属中山医院签订合作协议，成立肺癌、脂肪肝、胃肠肿瘤、脊柱微创、肺部结节等6大多学科诊疗中心（MDT）让南通人真正在家门口得到上海专家的优质医疗服务。与中国科学院苏州生物医学工程技术研究所签订全面战略合作，我院特色专科康复医学中心被确定为中科院苏州医工所临床研究基地，通过共建康复医学及工程技术联合研究中心、实验室，逐步推进双方研发立项、人才培养、国家科研项目的合作，打造国内外具有影响力的康复技术平台。医院不断引进技术新项目，形成一系列特色治疗，减轻了患者的痛苦，提高了服务水平，如机器人康复治疗、甲状腺微创治疗、男性阳萎治疗、静脉曲张微创、耳鼻咽喉微创治疗、儿科特色治疗等。
2014年，南通市区域卫生规划将我院规划为三级医院。目前，医院南扩工程一期9000平方米医技综合楼已投入使用。二期51343平方米门急诊病房综合楼项目纳入2015、2016年市政府“为民办实事”项目，2016年底已主体封底，2019年投入使用。三期拟征地(轴瓦厂地块)40亩，将新建康复医学中心、科教研实训中心、净化配送中心等。
在提升医院软硬件发展的同时，医院党委不断加强党建工作，有效地将党委的政治优势、党支部的组织优势和党员的素质优势转化为医院的核心竞争力，提升了服务水平。医院坚持长期为困难党员、贫困群众提供援助和关爱，形成“健康讲坛社区行”、“吴锦泉爱心服务队”等便民、惠民服务品牌。通过开展“党员先锋岗”、“满意服务中心”等创先争优活动，积极参加社会公益事业，投身扶贫帮困，助人为乐等志愿服务，真正体现了公立医院“救死扶伤、全心全意为群众健康服务”的公益性质。