南通市口腔医院位于南通市跃龙南路36号，毗邻国家5A级风景名胜区濠河。南通地区唯一一所公立口腔专科医院，江苏省口腔医学会副会长单位、南通市医学会口腔医学分会主任委员单位，南通市口腔医疗质量控制中心，南京医科大学教学医院、南通大学教学医院、国家住院医师规范化培训基地，上海九院正畸博士团队南通技术交流中心，韩国登腾种植牙南通技术交流中心、南通市基本医疗保险定点单位、南通市口腔卫生干预项目指定医院。医院集医疗、预防、教学、科研为一体，承担着南通市及周边地区广大居民口腔疾病临床诊疗和预防保健任务。
　　临床科室设置齐全，拥有口腔专业一级学科八个，口腔内科、口腔颌面外科、口腔修复科、口腔种植科、口腔正畸科、口腔预防保健科、急诊综合科、麻醉科；二级学科四个，牙体牙髓病科、牙周病科、粘膜病科、儿童牙病科；医技科室五个。其中正畸科是南通市临床重点专科、牙周病科是南通市临床重点专科建设单位，种植科是南通市临床特色专科。牙体牙髓科、种植科2014年申报临床重点专科。
　　医院医疗设备先进，拥有德国锥形束口腔CT、曲面断层全景X光机、数字化放射影像系统（DR）、X线头影测量系统、蔡氏口腔显微镜、德国史塞克正颌外科动力系统、瑞士种植机等国际先进医疗设备。HIS、LIS、PASC联网，实现了患者就诊信息管理现代化，各椅位实时传输患者检查结果，给患者就诊和科间会诊带来便捷。医院重视院感建设，投资数百万元建设消毒供应中心，三区划分合理，消毒程序规范。各诊室按院内感染管理要求配备循环风动态空气消毒机，彻底杜绝口腔诊疗中的医源性感染，保证患者治疗安全。医院业务用房5000平方米，椅位85张、颌面外科床位25张。新院位于跃龙南路36号（原崇川区政府大院），1.6万平方米，按三级口腔医院标准建设中，椅位150张、床位50张。
　　承担南京医科大学和南通大学口腔医学专业本科的临床教学，以及南通大学部分本科专业口腔医学理论授课。有南通大学兼职教授4名、副教授1名、讲师6名。近三年新增市级课题10项、市青年科研基金项目3项，参与国家级科研课题1项，获南通市科技进步二、三等奖3项；南通市新技术引进二、三等奖13项，发表SCI文章3篇。
南通市口腔医院目前是江苏省口腔医学会副会长单位、南通市医学会口腔分会主任委员单位。有中华口腔医学会正畸专委会常委1名、其他国家级口腔专业委员3名；省口腔医学会副会长1名，省级口腔副主任委员2名、常委、委员9名；市级主任委员1名、副主任委员1名、委员14名。高级职称24人，中级职称48人，口腔硕士、博士24人。
　　南通市口腔医院作为南通市医学会口腔医学分会主任委员单位，承担着指导全市医疗机构开展牙病防治及进行全市口腔卫生干预的任务，常年有一支专业的牙防队伍，深入到学校、机关、企事业单位进行口腔健康知识宣传和义诊，每年免费为崇川区四万名小学生进行口腔检查和五千余名儿童进行窝沟封闭治疗，为南通地区儿童口腔健康促进作出积极的贡献。
　　医院实行24小时值班制，口腔急诊综合科、口腔正畸科开展午间门诊、夜间门诊至晚上9点，节假日照常门诊。多年来先后被评为“创建文明卫生行业示范点”、“南通市文明单位”、“南通市文明诚信窗口”、“价格诚信先进单位”、“南通市创十佳医院先进单位”、“南通市医院管理年先进集体”、“南通市无红包医院”。在2013年至2014年南通市卫生局组织的医疗行风第三方满意度调查中，患者满意度一直居南通地区26家二级以上医院首位，深受患者的好评。