东山县医院是公立非营利性医院，建于1938年，几十年来，经过几代人的不懈努力，医院从小到大，由弱变强,实现了长足的进步和质的飞跃,已发展成为一所集医疗、科研、教学、预防、康复、保健为一体的现代化二级甲等综合医院，与福建医科大学附属第一医院、厦门市第一医院、厦门市第二医院等多家三级医院建立了紧密的医疗合作关系。医院于2015年下半年整体搬迁至新院址，新院总投资3.4亿元以上，占地123亩，建筑面积4万平方米，设置床位400张。
　　医院按照适度超前的指导思想，参考二级甲等综合医院标准进行规划设计，并为今后建设三级医院预留足够发展空间，主要有五大特色：一是医院整体环境优越，服务功能齐全，内置分体空调，设有先进的ICU(重症监护室)、NICU（新生儿重症监护室）、层流手术室、消毒供应中心、静配中心及优质病房、单人套房、高档套房等。二是配套功能齐全，设有中心吸引、消控室、双回路供电系统、自备电源、停车场、15部电梯等现代化配套设施。三是配备7000多万元的先进医疗仪器设备，其中有德国西门子64排128层螺旋CT、美国通用电气1.5T核磁共振、彩超（东芝、飞利浦、通用电气）、德国DR、钼靶、全自动生化分析仪、全自动血液分析仪、全自动免疫分析仪、血凝仪、全自动糖化血红蛋白分析仪、血气分析仪、尿沉渣分析仪等影像检验设备，同时购置腹腔镜、超声刀、膀胱镜、输尿管镜等设备，提高诊疗水平。四是开展导诊预约服务，门诊大厅和住院部设有导诊服务台，专科门诊候诊区设有分诊服务台，方便患者就诊；同时开展预约诊疗服务，采取网络、电话、自助等预约方式供患者选择。五是设立便民服务中心，将导诊、咨询、投诉、复印、出具疾病证明、医保盖章、预约诊疗、办理入出院手续等涉及医院对外服务的事项整合集中一个窗口受理和办理，实现了入、出院“一站式”服务，为患者提供了便捷的综合服务；增设自助存款缴费、自助排队、自助打印报告和票据等自助设备，减少取药、候诊排队次数，缩短了患者的等候时间。
　　医院现有职工395名，其中卫生技术人员325名。高级职称9名，副高职称22名，中级职称78名。医院设有临床科室10个，内一科（神内、呼吸、肾内、感染）、内二科（消化、心内、内分泌）、外一科（神外、骨外）、外二科（普外、泌尿外、胸外）、妇产科、儿科（内设NICU）、急诊科、重症监护室、手术室、麻醉科；门诊科室13个，内科门诊、儿科门诊、妇产科门诊、外科门诊、体检中心、血液净化室、口腔科、眼科、耳鼻喉科、皮肤科、康复科、中医肛肠门诊、中医骨伤门诊；医技功能科室5个，放射科（CT、DR、核磁共振、钼靶）、功能科（彩超、B超、脑电图室、心电图室）、检验科、病理科、内镜室（胃镜、肠镜、气管镜）；同时设置120急救中心，承担全县120指挥调度、日常医疗急救服务和突发事件的紧急医疗救援。
　　目前，无论在规模、病种诊治范围、设备仪器先进程度、特色专科、科技人才结构以及单病种治愈水平等方面，都达到了一定水平，有效的解决了群众看病难、看病贵的问题。